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《病毒学报》 2017年05期
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一株赛鸽源鸽圆环病毒全基因克隆与序列分析

孙兴臣  熊晓妍  李敏婕  李玉峰  姚大伟  万玉萌  孔志龙  许家荣  
【摘要】:鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是圆环病毒科的一个成员,是一种免疫抑制性病原。为了研究PiCV中国流行毒株的基因特征和遗传进化关系,本研究应用PCR方法对江苏省某赛鸽公棚的22份样品进行了PiCV检测,结果有6份样品为阳性。采用重叠PCR技术得到一株鸽圆环病毒全基因序列,命名为JS15-1(GenBank登录号:KX431143)。基因序列分析表明,JS15-1全长为2 034bp,包含3个主要开放阅读框。核苷酸同源性比较结果显示JS15-1与GenBank上登录的其他鸽圆环病毒分离株的全基因核苷酸同源性为85.3%~97.1%,与比利时分离的Bel20株同源性最高。不同鸽圆环病毒Rep基因同源性为92.1%~96.6%,Cap基因同源性为72.2%~99.4%。全基因遗传进化树显示JS15-1与之前的中国分离株处于不同的分支,而与Bel20的亲缘关系最近,Rep基因进化树显示JS15-1与Bel20、PiCV/Japan/2010、Ita4B位于同一分支,Cap基因进化树显示JS15-1与Bel20处于同一分支,亲缘关系最近。氨基酸序列比较发现,JS15-1与Bel20在Rep蛋白存在6个氨基酸残基的差异,而Cap蛋白存在1个氨基酸残基的差异和1个氨基酸残基的插入。研究结果表明,JS15-1极可能来源于比利时,而且发生了变异。
【作者单位】南京农业大学动物医学院;南京千里光生物技术有限公司;
【基金】:高校产学研合作创新项目(项目号:NAU201504-01),题目:赛鸽疾病诊断的研究与防治~~
【分类号】:S852.65
【正文快照】:
鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV,也被称为Columbid circovirus,CoCV),是一个小的,环状,无囊膜,单链DNA病毒,属于圆环病毒科的圆环病毒属。PiCV于1993年在美国发现[1],随后报道于澳大利亚[2]和欧洲的一些国家[3-5],近年来匈牙利[6]和日本[7]等国家也有PiCV感染的报道。2009

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